[Busla]

2k займёт чуть меньше меньше на диске; при максимально идентичной настройке требования к ресурсам у них будут тоже примерно одинаковые.
На 2k не добиться полноценной поддержки .NET - т.е. некоторый современный софт просто не будет работать. Ну и вообще многий криво-софт писался и тестировался исключительно под XP откуда и проблемы с Вистой. Поэтому лучше XP - меньше проблем.
Если без "большого напильника", то на этой конфигурации Home будет заметно порезвее, чем Pro.

FAT32 - это нештатный режим, хотя на небольших дисках может побыстрее в некоторых случаях.